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第47章 生物界重构宏其大 文学界难避偏见门（第1页）

在陈凯丽的点拨下，李宇轩的代码重构生物世界大业取得一系列的进展，先他定一个一个类，叫做生物类，给这个类定义了基本的一个属性：生存目标，默认值为两个，繁殖与存活，以及能量值属性。定义了几个方法：繁殖，死亡，遗传，演化，获取能量，设置了几个事件：当能量低于阈值时，当能量满足时，当环境适合繁殖时，当繁殖时，当繁殖成功时，当空闲时，当忙碌时。

从生物类六界系统分类下，向下定义和派生子类，定义出病毒界类、原核生物界类、真菌界类、原生生物界类、植物界类和动物界类，这些类继承了生物类的属性、方法和事件，并逐个进行重写和丰富各子类的内容。

病毒是颗粒很小、以纳米为测量单位、结构简单、寄生性严格、以复制进行繁殖的一类非细胞型微生物。病毒是比细菌还小、没有细胞结构、只能在活细胞中增殖的微生物。病毒由蛋白质和核酸组成。病毒界类的属性在继承生物父类的属性，具有繁殖和存活的目标属性，病毒本身没有细胞构造，其主要成分仅为核酸和蛋白质两种，故又称“分子生物”

：每一种病毒只含一种核酸，不是dna就是Rna，病毒只能利用宿主的存活细胞内现成代谢系统合成自身的核酸和蛋白质成分，以核酸和蛋白质等“元件”

的装配实现其大量繁殖；在离开宿主活细胞的条件下，有些病毒能以无生命的生物大分子状态存在，并长期保持其侵染活力。

dna和Rna是核酸的两种类型，dna是脱氧核糖核酸，Rna是核糖核酸。dna（脱氧核糖核酸）的基本组成部分是脱氧核苷酸。脱氧核苷酸是一类由嘌呤或嘧啶碱基、脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的小分子化合物，是构成生物体遗传物质dna的物质基础。脱氧核苷酸中四种碱基腺嘌呤（adenine，缩写为a）、胸腺嘧啶（thymine，缩写为t）、胞嘧啶（nete，缩写为nete，缩写为g）排列顺序的不同，决定了生物的多样性。Rna是核糖核酸的基本组成部分是核苷酸，核苷酸是一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。Rna由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和碱基构成。Rna的碱基主要有4种，即a（腺嘌呤）、g（鸟嘌呤）、c（胞嘧啶）、u（尿嘧啶），其中，u（尿嘧啶）取代了dna中的t（胸腺嘧啶）。

李宇轩严格按照陈凯丽提供的生物知识的结构，又单独定义了dna类、Rna类、以及碱基类和碱基类的子类，agcut。生物的遗传物质，正是通过这些碱基的不同排列组合传递的，如何组合传递如何的信息，已经不在李宇轩的研究范畴，他严谨的只是建立好了类的结构。李宇轩问过张凯丽，这些碱基是否都有明确的化学结构和分子式，张凯丽只要是存在的，一定有明确的化学结构和分子式，而其自身的组合，就无穷无尽了，无论组合，都只是碳、氢、氧、氮四个元素的组合。

李宇轩惊讶的感叹道："

那岂不是可以人造这些dna、Rna，在通过他们的组合存放下我这个类定义的代码。代码重构生物，生物记录代码。"

张凯丽打趣道："

理论上是可以的，弄好了，你就是造世主了，到时候把我造的更漂亮点，我就不来辛苦读这个博士了，靠扭扭腰吃饭，活的俗不可耐一点。"

定义原核生物界类的时候，李宇轩同时定义了细胞类。原核生物是一种单细胞生物，缺乏细胞核和其他膜结合细胞器。在生物分类的三域系统中，基于分子分析，原核生物分为两个域：细菌（原真细菌）和古细菌（原古细菌）。具有细胞核的生物体位于第三个领域，即真核生物。

在生命起源的研究中，原核生物被认为出现在真核生物之前。原核生物的繁殖方式为细胞分裂繁殖。原核生物单细胞会以简单二分裂方式繁殖，无有丝分裂或减数分裂，没有性行为，有的种类有时有通过接合、转化或转导，将部分基因组从一个细胞传递到另一个细胞的准性行为。

在定义细胞类的时候，根据系统的定义，细胞是一切生物体形态结构和生理功能的基本单位，均由细胞膜、细胞质与细胞核三部分组成，细胞膜：由膜脂、膜蛋白及膜糖类组成，是包裹于细胞表面、将细胞与周围微环境隔离的界膜，构成特殊屏障，在细胞的生命活动中起着重要作用；细胞质：又称胞浆，是由细胞质基质、细胞器和包涵物组成；细胞核：由核被膜、染色质、核仁与核基质四部分组成。细胞核含有dna遗传信息，通过dna的复制与转录，细胞核成为细胞增殖、分化代谢等功能活动的重要结构。细胞核中也有Rna，不过大部分Rna在细胞质内，在Rna聚合酶的作用下，dna可根据模板合成互补的Rna链，这个Rna被称为信使核糖核酸，主要在细胞核内合成。

李宇轩在细胞类的定义中中，按照结构，细胞膜、细胞质、细胞核被分别定义为新的数据类，并且又以细胞类的属性存在，而细胞核属性中的dna属性，又只能赋予dna类的实例。

细胞是组成真菌、原生生物、植物和动物的基本组成部分。在整个生物界，除了病毒，其他的生物都是由细胞所构成，而原核生物就是一个原始的细胞，而病毒，恰恰是组成任意细胞核或者细胞质中的dna或者Rna的一个片段，细胞却并非一定由某些片段组成，但这些病毒作为这些片段要靠侵入细胞而生存，继而执行演变、繁殖或者死亡的方法。

真菌界均属真核生物，真菌广泛分布于全球各带的土壤、水体、动植物及其残骸和空气中，营腐生、寄生和共生生活。真菌界是指营养方式为异养的真核菌类。分为真菌门和粘菌门，真菌界细胞无质体，不含叶绿素，不能进行光合作用，其营养方式不是自养而是异养，能分解和吸收有机物质，腐生或寄生，细胞壁的化学组成除少数为纤维素外，大多由几丁质构成。而粘菌更为特殊，生活史中有动物性阶段和植物性阶段，动物性阶段的有机体无壁，仅为一团裸露的原生质，而且可作变形运动，吞食细菌和有机物颗粒;在植物性阶段则形成孢子囊，产生具纤维素壁的孢子。少数真菌为单细胞，大部分真菌为多细胞结构，而细菌则是真菌界的单细胞生物。真菌是一大类具有细胞壁和典型细胞核，不含叶绿素，不分根、茎、叶的微生物。

真菌的繁殖方式包括无性生殖、有性生殖和准性生殖。无性生殖是指不经过两性细胞的结合便产生新的个体。有性生殖有游动配子配合、配子囊接触交配、配子囊交配、性孢子配合和体细胞配合等形式。有的真菌在质配后立即进行核配。重新使染色体的数目减为单倍。有性繁殖方式因菌种不同而异。对多数真菌来说，由菌丝分化形成特殊的性胞（器官）配子囊或由配子囊产生的配子来相互交配，形成有性孢子，两个有性细胞结合以后产生新个体。

根据产生有性孢子菌丝来源或亲和力不同，一般可分为同宗配合和异宗配合两类。同宗配合是指不同交配型的核在一个菌丝体中，即每一菌体都是自身可孕的，不靠别的菌体帮助而能独立地进行有性生殖。异宗配合是是指每一菌体都是自身不孕的，不管它是否雌雄同体，都需要借助另一个可亲和菌体的不同交配型来进行有性生殖，以“+”

和“-”

来表示两个不同质的细胞。

那日沉浸于真菌类篇章研读的少闹钟李宇轩无法自拔，又在陈凯丽的宿舍里和她刚进行完毕一场精彩的性探讨，事毕刚心生贤者时刻的空洞感，又旋即想到这有性繁殖居然从真菌就开始了，顿时全然索然无味："

凯丽，你说这真菌都干的事，咱两个人咱干的还那么津津有味呢？"

张凯丽看着李宇轩，噗嗤笑了出来，拿出身边的一本《真菌繁殖》教科书，翻了翻找到一页，念了起来："

现真菌存在性分化现象。大多数真菌是雌、雄同株的，即同一个菌体上可以分化出雌、雄配子体，少数为雌雄异株的，即一些菌株只产生雌配子体而另一些菌株只产生雄配子体。然而并不是所有雌雄同株的真菌都可以单株进行有性生殖。雌、雄配子体可以交配完成有性生殖的称为性亲和（sexua1patib1e），不能交配的称为性不亲和（sexua1inpatib1e）。有些真菌单个菌株就可以完成有性生殖称为同宗配合（homotha11ism），而多数真菌为异宗配合（heterotha11ism）的．即单个菌株不能完成有性生殖，需要两个性亲和菌株共同生长在一起才能完成有性生殖。多数真菌如鞭毛菌、接合菌、子囊菌及少数担子菌的异宗配合特性一般由一对等位基因（通常用a、a表示）控制，因此可以分为两种交配型，即“+”

菌株和“-”

菌株。“+”